Katastrofen i München kom som en stor shock för United, och de inför de sista matcherna fick man bygga upp ett i stort sett helt nytt lag. Murphy köpte snabb Emie Taylor och Stan Crwother. De, tillsammans med Bill Foulkes, Harry Gregg and en blandning av reserv- och juniorlagsspelare fick ingå i laget som skulle slutföra säsongen. Man köpte även in Wilf McGuiness, Warren Bradley och Albert Quixall. The Reds klarade sej mycket bra i ligan och man slutade på en andraplats och gjorde 103 mål, av vilka Bobby Charlton stod för 29 stycken.

1959/60

Efter katastrofen så kämpade man för att återuppbygga sitt förut så starka lag. Albert Quicall hade köpts in 1958, men han lyckades inte lika bra här som han hade gjort i sin förra klubb, Sheffield Wednesday.

Maurice Setters köptes för att täppa till ett ihåligt försvar som hade släppt in 54 bollar på 25 matcher. De nya spelarna kombinarades med de lite äldre och mer rutinerade spelarna som, Charlton, Gregg, Foulkes, Dawson, Brennan, Giles, McGuinness, och Dennis Viollet. Viollet fortsatte att göra mål och gjorde rekomånga 32 mål på bara 36 matcher. Publik på upp till 65.000 följde dem trots att resultaten uteblev. Man slutade på 7:e plats och åkte ur FA cupen i femte omgången.

1960/61

Busby förstärkte laget med Cantwell som han köpte in från West Ham, Dunne från Irland och de egna grabbarna, Stiles och Gaskell. Detta året gick som det förra och man slutade på en 7:e plats. Trots att derbyt sågs av 61.000 och matchen mot Spurs av 65.000 så började publiksiffrorna att sjunka. För första gången i historien så spelade man liga liga-cupen, men där förlorade man redan i den andra omgången.

1961/62

Nu förstärkte man med Herd från Arsenal. Och man försvaret förstärkes också med Chisnalls debut. Man slutade på en medioker 15:e plats och åkte ut ur FA cupen i semi-finalen. Även denna säsongen så svek publiken på grund av laget dåliga resultat. Bäste målskytt blev nyförvärvet Herd med 14 mål.

1962/63

1962 så köpte man in två nya spelare som skulle komma att ha enorm betydelse för United. Denis Law köptes från Torino, Eric Cantona må vara den "unga härmaren" men Denis Law är fortfarande "the King" i United. Med detta köpet hade man inte bara köpt en underbar fotbollspelare utan även en underhållare som bjöd på sej själv, och folk kom från hela landet för att se honom. Pat Crerand köptes från Celtic, och han hade en underbar teknik. Så fort som han kom till klubben så förvanlades "the Lawman" från att ha varit strålande till ett riktigt geni, och det var tack vara Pat. För laget gick det sämre och man slutade på en 19:e plats. Men man lyckades bättre i FA cupen och nådde final där man skulle möte Leicester, och man vann en oförglömlig match med 3-1.

1963/64

Succeen i cupen gjorde att folket drog sej tillbaka till Old Trafford. Nya spelare för United var Sadler, Anderson, och den ineffektive Moore från Chelsea och den magiska George Best, samt John Connelly. Trion Charlton, Law och best ("holy trinity") skulle komma att skapa ett namn som skulle komma att sätta skräck i motståndarlag överallt.

1964/65

United särkte sitt lag ytterligare med Fitzpatrick, Aston, och Dunne. Och medgång kom åter till Old Trafford i form av det första ligaguldet sedan 1957. I FA cupen kom man till semi-finalen. Deras framgång hade åter igen gjort att mellan 55.000 och 63.000 åskådare inte var ovanligt.

1965/66

Ryan och Noble var Uniteds nya spelare för året. Publiken flockades och man kom på 4:e plats i ligan och åkte även i år ut i semi-finalen av FA cupen.

1966/67

Alex Stepney köpte från Chelsea för att förstärka en position som hittils var en svag punkt för dem. Målvakter hittils hade Gregg Gaskill och nyinköpte Dunne var. Men nu tog Stepney över i målet. Man vann ligan för sjunde gången. Mer än 60.000 såg United hela åtta gånger den här säsongen.

1967/68

Uniteds lag förstärktes ytterligare med Burns, Gownling, Rimmer och Brian Kidd. Bara i ligan så hade med över 60.000 hela 12 gånger. 100.000 i huvudsak United-fans såg klubben lyckligaste tillfälle någonsin. Man slog Benfica med 4-1 i europacupfinalen på Wembley 19 maj. United blev det första engelska lag som fått höja denna buckla. Bobby Charlton gav United ledningen, men Graca kvitterade och matcher gick till övertid. Där gjorde först George Best mål och sedan Charlton mål, målskyttet avslutades av Brian Kidd som firade sin 19:e födelsedag.

Det här var drömmen för Busby och han adlades av drottningen som tack för sin hängivenhet åt fotbollen. Charity Sheild matchen slutade oavgjort och man kom på andra plats i ligan, efter Man City. Men detta glömdes fort när man hade vunnit det största av de största, europacupen.

1968/69

Morgan, Sartori och James var klubbens nyförvärv och trotts att man spelade en attraktiv fotboll och drog en stor publik så verkade det som att man höll på att tyna bort efter succeen i Europa. Man blev 11:a i ligan och åkte ut i semin i europacupen. Detta avslutade ett svagt år för klubben.

Alla drömmar om att åter igen vinna i Europa krossade av Milan som totalt vann med 2-1. Man förlorade även världfinalen mot argentinska Estudiantes med 2-1. Sir Matt Busby valde att avsäga sej kontrollen för laget och blev istället general manager i Manchester United. Wilf McGuinness tog över efter Busby.

1969/70

Ett kaotiskt år för klubben slutade utan någon framgång. Best visade sej på sin värsta sida och accepterade inte att McGuinness ledde klubben. Man slutade på en 8:e plats och åkte ut i semi-final av FA cupen. Och även i ligacupen så förlorade man i semin. Så småningom så tog Sir Matt Busby än en gång över klubben i december.